1、设立新三板，主要目的是为创业企业融资提供服务；
2、北京作为全国第一个“试点”城市，有先发优势（虽然试点效果很不理想）；而且，北京作为政治中心，很多事情可以不走寻常路，所以才有先期的新股发行试点和后来的新三板的“创新试验”；
3、设立新三板，是政府职能转变的尝试。从历史上看，对于非上市公司的管理一直是政府主管经济工作的重点之一，如企业年检等。而新三板的出现，将一部分股权交易的审核权限下放，并引入了市场化的机制（尽管目前是政府主导），从而实现了监管与市场的分离。从这个意义上说，新三板是一种制度的创新，而且是政府职能转变的积极探索；
4、设立新三板，也是构建多层次资本市场的重要组成部分。目前世界上主流的市场都是多层次的市场结构，中国也不例外。目前我们有多层次资本市场的构想，一是完善现有沪、深交易所为主的一层市场和二板市场；二是大力发展新三板。两者相互补充，满足不同成长阶段企业的融资需求。
堵欣惠优质答主全国股份转让系统的建设和发展的突出特点之一是市场辐射与区域示范并重，这主要是基于中国新三板市场建设初期资源相对有限等客观条件的考虑，通过政府与市场的有效联动，发挥中央政府直属机构与地方政府的双重力量，调动各方资源，为系统平台建设和业务发展提供保障，并带动区域经济发展，实现共建共享发展的目的。
全国股份转让系统采取公司制的市场运营组织形式，作为全国股份转让系统法人主体的全国股份转让系统有限责任公司承担市场运营管理职责。国务院相关文件明确，全国股份转让系统有限责任公司注册设立地为北京市。为此，全国股份转让系统在北京建设运营总部基地，开展市场管理和组织交易的系统平台建设，组织、监督市场的交易活动及相关业务活动，并为非上市公司股份及其他金融产品提供公开转让服务。
为落实国务院关于发挥全国股份转让系统带动区域经济发展作用的相关要求，支持全国股份转让系统与区域股权交易市场实现信息共享和业务合作，发挥市场辐射和示范效应，全国股份转让系统将建设区域市场管理和服务平台。区域市场管理和服务平台的载体为全国股份转让系统分公司。全国股份转让系统分公司的组建、设立、运行等市场管理事项另行规定。
